През 2001 г., с помощта на компанията Coty, Marc Jacobs лансира първия си парфюм, Marc Jacobs for Women, последван през 2002 г. от мъжкия му събрат Marc Jacobs for men. След тях излизат парфюми като Blush (2004), лимитираното издание I Love Marc (2007), Lola (2009) и др. Някои от последните парфюми на Marc Jacobs са Oh, Lola! и Bang Bang (2011) и излезлият през 2012 г. Marc Jacobs Dot. През 2012 г. Marc Jacobs лансира и колекцията си парфюми Splash Tropical Hibiscus & Kumquat, последната колекция от серията Splash, чиято първа колекция излиза през 2006 г.